Παρά το γεγονός πως η «κρίση» που είχε ξεσπάσει ανάμεσα στον Υπουργό Παιδείας και τον αρχιεπίσκοπο Ιερώνυμο φάνηκε να εκτονώνεται μετά τη συνάντηση όλων των πλευρών στο μέγαρο Μαξίμου, ο Νίκος Φίλης σήμερα επέλεξε να «αντεπιτεθεί» τονίζοντας χαρακτηριστικά: «η πρόσφατη διαμάχη για τα θρησκευτικά ελπίζουμε να μην επιβεβαιώσει τους φόβους μας ότι η ιεραρχία επιχειρεί να θέσει όρους εισβάλοντας και πάλι στην πολιτική».
Αναλυτικά η Νίκος Φίλης από βήματος του 2ου συνεδρίου του ΣΥΡΙΖΑ τόνισε: «Μια από τις εκκρεμότητες είναι και η σχέση εκκλησιάς – πολιτείας. Υπάρχουν πολλά πεδία διευκρινίσεων που δεν προϋποθέτουν συνταγματική αναθεώρηση… Επιδίωξη της εκκλησιαστικής διοίκησης είναι να ασκεί έλεγχο φρονηματισμού επί των μαθητών.
Η πρόσφατη διαμάχη για τα θρησκευτικά ελπίζουμε να μην επιβεβαιώσει τους φόβους μας ότι η ιεραρχία επιχειρεί να θέσει όρους εισβάλοντας και πάλι στην πολιτική.
Δεν πρόκειται για αντιπαλότητα είναι υπεράσπιση για εμάς του κοσμικού χαρακτήρα του δημόσιου χαρακτήρα του δημόσιου σχολείου».